制药工程专业成立于2004年，本科学制四年，授予工学学士学位。专业本着“实基础，宽口径，强能力，重创新”的原则制定人才培养方案，突出制药工程专业实践能力的培养。本专业旨在培养拥护党的基本路线，德智体美劳全面发展的社会主义建设者和接班人。毕业生应具有良好的品德修养、三农情怀、较强社会责任感，掌握扎实的制药专业基本理论、基本知识和基本技能，能胜任制药及相关领域的工程与工艺设计、药品生产与质量管理、药事管理与服务等工作需要的应用型高素质人才。
本专业现有专兼职教师12名，其中博士学位2人，在读博士2人，硕士及以上学历占比92%。其中教授4人，副教授3人，高级职称占比58%。双师型教师占比100%。
本专业毕业生可以在各类制药生产企业、制药研究部门、药品监督管理部门、医药公司等企事业单位从事教学、研究、开发、生产、管理、经营及技术服务等工作，也可进一步学习深造。